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大大减少农药用量,交大陈功友教授团队用基因编辑“干掉”水稻病菌[图]

新闻晨报·周到上海报道 2019年10月16日是第39个世界粮食日。上海交通大学陈功友教授领衔的植物与病原菌分子互作研究团队今天对外发布最新科研成果,找到了水稻病原菌效应蛋白这个“间谍”与植物感病基因“接头人”之间的协同进化关系,获得了广谱抗白叶枯病的水稻新种质。

陈功友教授团队目前正在将该技术应用于优良杂交水稻亲本的改良中,预计1-2年内可育成稳定遗传的品种,将大大缩短杂交水稻育种年限。

广谱持久抗病水稻新品系与对照水稻

随着这些高产又抗病的品种在生产上的推广应用,农药的用量将急剧减少,农民生产水稻的经济和人力成本将大大降低,老百姓也将在餐桌上吃到更加优质安全的大米。 

目前,该研究成果在线发表在Cell出版社旗下植物科学领域权威期刊《Molecular Plant》。

 

 陈功友教授(右)在田间查看白叶枯病病情 

白叶枯病:危害水稻生产的头号细菌“杀手” 

水稻是世界上最重要的粮食作物之一,水稻白叶枯病是三大水稻病害之一,是危害水稻生产的头号细菌“杀手”。

该病在亚洲、拉丁美洲和西非数十个国家的水稻种植区广泛发生,国内目前除了新疆和东北的北部地区以外,其他省市的水稻种植区均有分布。

水稻白叶枯病通常导致水稻减产10-20%,发生严重的地区可达50%以上,甚至是绝收。同时水稻白叶枯病也是植物病理学和植物免疫学领域最重要的模式系统之一,在科学上具有重要研究价值。

 

水稻白叶枯病 

大量筛选,发现病原细菌新“间谍”

植物病害发生的过程,就是病原菌与植物双方投入大量“兵力”进行的一场没有硝烟的战争。

为了抵御病原菌的入侵,植物通过角质、蜡质等多种生化物质构筑起一系列坚固的物理和化学“堡垒”。

病原菌则通过合成胞外降解酶、毒素等物质“明修栈道,暗渡陈仓”的兵法来“攻击”这些“堡垒”。

另一方面还通过组装多种被称为分泌系统的装置“暗渡陈仓”,将大量的效应蛋白“间谍”直接分泌到植物体“堡垒”内部,这些“间谍”在植物体内部大肆破坏,最终使“堡垒”从内部被“攻破”,植物发生病害。

水稻白叶枯病菌派出的最重要的一类效应蛋白“间谍”是III型分泌系统分泌的转录激活因子类效应蛋白(TALE蛋白),其中只有少数几个毒性作用明显,称为主效TALE蛋白。

陈功友教授团队在农业部公益性行业专项等项目支持下,多年来从全国各水稻产区的发病田块收集分离出数百个白叶枯病原菌株,在不同的水稻品种上测定了这些菌株的毒性,并进行分子标记分析,发现这些中国菌株具有丰富的遗传多样性和毒性差异。通过基因组学和分子生物学工具,从其中几个强毒性菌株中分离到数十个TALE蛋白编码基因并分别测定毒性,最终“识破”了一类被称为PthXo2-like的新型主效TALE蛋白“间谍”,并且在不同的菌株中发现了这类蛋白的五种类型。 

反复验证,确定水稻“间谍接头人”

抗病水稻品种的抗病效果

水稻白叶枯病菌分泌的TALE蛋白“间谍”进入植物细胞后,能够躲过植物免疫系统的侦查,伪装成水稻自身的转录激活因子,与“潜伏”在水稻细胞内的一类感病基因“接头人”进行“联络”。

“接头暗号”是双方特定氨基酸序列与DNA序列之间的一套密码。一旦“对上了暗号”,TALE蛋白就能够识别并结合在病基因启动子的相应区域,激活感病基因的表达,从内部“攻破”植物的防线。

研究团队通过对新发现的 “间谍”蛋白序列进行比较分析,初步确定水稻感病基因OsSWEET具有“接头人”嫌疑。

接下来经过不同分子生物学实验的反复验证,最终确定该基因即为该类“间谍”的靶标基因“接头人”。

同时,对3000份水稻种质资源基因组进行的分析发现,该基因在启动子识别区域也存在十种不同的类型。从而证明病原菌的效应蛋白“间谍”与水稻感病基因“接头人”之间呈现出一种“军备竞赛”的协同进化关系。

 陈功友团队根据水稻感病基因“接头人”OsSWEET与病原细菌TALE蛋白“间谍”之间的关系,采用新兴的基因编辑技术这一研究利器,干扰“间谍”与“接头人”之间“接头暗号”的识别,从而同时阻断多个细菌TALE蛋白“间谍”的破坏活动,最终获得了广谱抗白叶枯病的水稻新种质。