2026年2月12日，上海交通大学数学科学学院陈洛南教授研究团队合作在国际顶级学术期刊《Cell》上作为共同通讯作者发表了题为“CLIM-TIME identifies metastatic microenvironment modulators for T cell therapy response”的论文。该研究团队由中国科学院分子细胞科学卓越创新中心王广川研究员、上海交通大学数学科学学院陈洛南教授、广州实验室景乃禾研究员组成。团队揭示了肿瘤如何通过遗传突变改造微环境进而导致免疫治疗耐药的基本规律，建立了高维数据解卷积新算法，成功识别了可显著提升T细胞“战斗力”的靶点，开发了可准确预测免疫治疗效果的AI模型。

团队成功研发出新型技术方法平台CLIM-TIME，实现对转移瘤的转录组、反卷积及免疫荧光多维度分析，首次在高通量尺度上破解了肿瘤遗传突变与转移瘤微环境、免疫治疗效果之间的关联密码，为解决临床中转移瘤免疫治疗耐药难题提供了全新策略与技术支撑，有望推动T细胞免疫治疗向更精准、更有效的方向发展。

团队构建了两套核心分析模型：一是在细胞分类与微环境分型方面，通过建立贝叶斯概率模型完成粗粒度细胞分类，显著提升了反卷积分析的稳定性与可解释性，为理解不同驱动突变背景下的免疫生态格局提供了系统、精准的分类图谱；二是在免疫疗效预测方面，运用自主研发的因果推断方法NME，构建出可临床转化的免疫疗效预测模型，能够快速计算免疫疗效风险评分，显著降低临床检测成本与难度，为肿瘤精准分层治疗提供可行方案。

该研究不仅为解析转移瘤免疫治疗耐药机制提供了全新工具，也为开发新型联合治疗策略、攻克实体瘤转移耐药难题开辟了新路径。

论文链接：https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(25)01491-6