自1983年我校与德国一流理工大学––柏林工业大学建立合作关系以来，双方通过教授互访、举办双边学术会议等，加强交流，关系密切。双方的合作主要集中在计算机科学、机械工程、制冷、自动化、材料科学、管理科学、科技史和环保化工等方面。

　　2003年3月29日，在两校合作20周年之际，两校在上海签署了联合办学合作协议。根据协议规定，两校互派研究生到对方学校学习，在修满规定学分、考试成绩及格并完成硕士论文之后，可同时获得我校和柏林工业大学双硕士学位。该联合培养项目得到中德双方高度重视，并被德国主流媒体称为中德联合培养高层次人才的先驱者。2005年双方进一步加大合作力度，签署了本科学生交换协议。

　　2004年9月，两校联合培养项目进入实施阶段，获准参加联合培养项目的电院本科生，将从大学二年级下学期开始，接受为期一年的德语强化培训，主要利用周末和晚上的时间及寒、暑假进行学习。之后，即参加德语语言考试（Test DaF）。在通过德语考试，并获得德方和我方认可之后，即可在大学四年级上学期前往德国柏林工大进行为期两年的学习；之后，须返回我校电院继续硕士阶段最后一年半的学习。

　　学校领导高度重视该项目的实施情况，印杰副校长亲自关心该项目的进展。截至目前，项目进展十分喜人。电院共派出计算机系2001级学生刘思中等4人，2002级计算机系黄智轶、张志远等7人，2003级所属六个本科专业的袁嘉婧、秦康平等12人，前往柏林工大学习两年。目前，2001级计算机系的四位同学已经圆满完成了在德国的学习任务，按照协议的要求，返回上海交通大学继续交大方面研究生阶段的学习生活。与此同时，柏林工大方面也从2003年起派出学生来到我校电院就读，攻读电院计算机系的硕士学位。

　　2006年6月，校党委书记、校务委员会主任马德秀教授率我校代表团应邀访问柏林工业大学，出席了两校合作举办的计算机专业双硕士学位联合项目的首届毕业典礼。马主任向德国毕业生颁发了我校的毕业证书和学位证书。